Добрый день.
Всем спасибо. Стук нашёл.
В шарнирах крышки есть маленькие отбойники пластиковые.
И вот они подизносились. Один новый такой на экзист стоит 289 грн(
Пока что подложил резинки на них и стук пропал.

...при этом крышка багажника закрыта намертво..